MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC8

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017071	GAA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017071	A	7	7	1383	1389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017071	GAAA	2	8	1420	1427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017071	GAA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017071	T	7	7	1710	1716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017071	TTG	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017071	GCC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017071	GCG	2	6	1799	1804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017071	GCT	2	6	1805	1810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017071	GA	3	6	1812	1817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017071	CGG	2	6	2445	2450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017071	CGGG	2	8	2453	2460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017071	GGTG	2	8	2461	2468	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017071	TG	3	6	2467	2472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017071	GCC	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017071	CGG	2	6	2517	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017071	CGGTG	2	10	2533	2542	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017071	GCGGT	2	10	2546	2555	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017071	TGG	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017071	GTG	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017071	AGG	3	9	2591	2599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017071	GCGG	2	8	2621	2628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017071	GAAA	2	8	2669	2676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017071	A	6	6	2720	2725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017071	AAT	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017071	TCA	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017071	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017071	GTT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017071	GA	4	8	2861	2868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017071	AAC	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017071	GA	3	6	2924	2929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017071	GTC	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017071	CTA	2	6	3019	3024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017071	AGGG	2	8	3030	3037	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017071	GAG	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017071	A	6	6	3171	3176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017071	TTGCT	2	10	3180	3189	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017071	AGG	2	6	3217	3222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017071	A	6	6	3235	3240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017071	GGT	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017071	AT	3	6	4280	4285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017071	CGT	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017071	CT	3	6	4294	4299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017071	CAAT	2	8	4362	4369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017071	AGA	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017071	TGTT	2	8	4453	4460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017071	TGTT	2	8	4472	4479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017071	C	6	6	4488	4493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_017071	GCCA	2	8	4494	4501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017071	AGT	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.